Emnebeskrivelse for studieåret 2022/2023 Akvagenomikk og bioinformatikk BI311F Beskrivelse av emnet Emnet tar for seg grunnleggende bioinformatikk, analyse av DNA-sekvenser, sekvenssammenstillinger, BLAST, annotering av genomer, konstruksjon av fylogenetiske trær, synteni-analyse, og storskala genuttrykk-analyse. Forkunnskapskrav Studenten må være kvalifisert for Master i biovitenskap. Kostnader Ingen kostnader utover semesteravgift og pensumlitteratur. Læringsutbytte Kunnskap og forståelseStudenten skalHa en oversikt over de viktigste sidene ved komparativ og funskjonell genomikkMestre essensielle bioinformatiske konsepter og ha kjennskap til de riktige bioinformatiske verktøyHa kunnskap om relevante aspekter innen molekylærbiologi og biokjemiForstå hvordan genomforskning kan brukes til å løse aktuelle problemer innen akvakultur og økologiKjenne til prinsipper for dataanalyse av storskala funksjonell genomikk dataFerdigheterStudenten skalHa ferdighet innen databehandling og kunne bruke ulike bioinformatiske applikasjonerVite hvordan man analyserer store DNA-sekvenserte datasettVære i stand til å undersøke og forutsi strukturen i eukaryote-generVære i stand til å undersøke evolusjonære relasjoner mellom gener og genomer fra ulike arterVite hvordan du henter data fra elektroniske databaserVære i stand til å få tilgang og forstår vitenskapelig litteratur tilknyttet feltetGenerell kompetanseStudenten skalForstå og anvende genomikk og bioinformatiske konsepter knyttet til "cutting edge" havbruksforskningKunne diskutere og presentere vitenskapelige artikler i genomikk og bioinformatikkHar kompetanse til å delta på forskningsprosjekter innen i bioinformatikk og genomikk Type emne Valgemne:Master biovitenskapNordisk master i bærekraftig produksjon og utnyttelse av marine bioressurser Undervisningsform Samlingsbasert undervisning. Læringsaktiviteter og undervisningsmetoder Forelesninger, veiledning og datalab. Anbefalte forkunnskaper Evne til å gjøre utregninger, samt kunnskap om molekylær biologi, biokjemi er en fordel. Emneevaluering Studieprogrammet evalueres årlig av studentene gjennom emneundersøkelser (midtveisevaluering og sluttevaluering). Evalueringene inngår som en del av universitetets kvalitetssikringssystem. Vurderingsordning Sammensatt vurdering, karakterregel Bokstavkarakterer Muntlig presentasjon, teller 40/100 av karakteren, karakterregel Bokstavkarakterer .Oppgave - Skriftlig rapport, teller 60/100 av karakteren, karakterregel Bokstavkarakterer . Overlappende emner BI311F-001v1 Akvagenomikk og bioinformatikk - skoleeksamen - 5 studiepoeng.BI311F-002v1 Akvagenomikk og bioinformatikk - laboratoriearbeid - 3 studiepoeng.BI311F-003v1 Akvagenomikk og bioinformatikk - muntlig presentasjon - 2 studiepoeng.BI311F-001v1 Akvagenomikk og bioinformatikk - skoleeksamen - 10 studiepoeng. Pensumlitteratur Campbell AM and Heyer LJ (2006). Discovering Genomics, Proteomics and Bioinformatics. Benjamin Cummings (2nd ed.). ISBN 0805382194. Hunt S and Livesey R (2000). Functional Genomics: A Practical Approach. Oxford University Press, USA (1st ed.). ISBN 019963775X. Xiong J (2006). Essential Bioinformatics. Cambridge University Press. ISBN 0521600820. Brown T (2006). Genomes 3. Garland Publishing Inc,US. ISBN 0815341385Forelesningsnotatene utgjør pensum. Inngår i følgende studier Det ser ut som om JavaScript ikke er aktivert i nettleseren din. Vennligst aktiver JavaScript, og prøv på nytt. Nordisk master i bærekraftig produksjon og utnyttelse av marine bioressurserhttps://www.nord.no/no/Student/studieplaner/marbioNordisk master i bærekraftig produksjon og utnyttelse av marine bioressurserMastergrad iht §3, 2 årMaster i biovitenskaphttps://www.nord.no/no/Student/studieplaner/mabioMaster i biovitenskapMastergrad iht §3, 2 årInternasjonale studenterhttps://www.nord.no/no/Student/studieplaner/2015h/Sider/INTER.aspxInternasjonale studenterHalvårsstudium og kortereMaster i marin økologihttps://www.nord.no/no/Student/studieplaner/2015h/Sider/MAMAE.aspxMaster i marin økologiMastergrad iht §3, 2 årMaster i havbrukhttps://www.nord.no/no/Student/studieplaner/2015h/Sider/MAMAR.aspxMaster i havbrukMastergrad iht §3, 2 årMaster i havbruk - deltidhttps://www.nord.no/no/Student/studieplaner/2015h/Sider/MAMD.aspxMaster i havbruk - deltidMastergrad iht §3, 2 år Emneansvarlig Jorge Manuel de Oliveira Fernandes Professor +47 75 51 77 36 jorge.m.fernandes@nord.no Undervisningssemester Vår 2023 Språk Engelsk Studiepoeng 10,0 Studiested Bodø Ansvarlig fakultet Fakultet for biovitenskap og akvakultur Jorge Manuel de Oliveira Fernandes Professor +47 75 51 77 36 jorge.m.fernandes@nord.no