Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2023/24)
Akvagenomikk og bioinformatikk
BI311F
Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2023/24)

Akvagenomikk og bioinformatikk

BI311F
Emnet tar for seg grunnleggende bioinformatikk, analyse av DNA-sekvenser, sekvenssammenstillinger, BLAST, annotering av genomer, konstruksjon av fylogenetiske trær, synteni-analyse, og storskala genuttrykk-analyse.
Studenten må være kvalifisert for Master i biovitenskap.
Studenten må være kvalifisert for Master i biovitenskap.

Kunnskap og forståelse

Studenten skal

  • Ha en oversikt over de viktigste sidene ved komparativ og funskjonell genomikk
  • Mestre essensielle bioinformatiske konsepter og ha kjennskap til de riktige bioinformatiske verktøy
  • Ha kunnskap om relevante aspekter innen molekylærbiologi og biokjemi
  • Forstå hvordan genomforskning kan brukes til å løse aktuelle problemer innen akvakultur og økologi
  • Kjenne til prinsipper for dataanalyse av storskala funksjonell genomikk data

Ferdigheter

Studenten skal

  • Ha ferdighet innen databehandling og kunne bruke ulike bioinformatiske applikasjoner
  • Vite hvordan man analyserer store DNA-sekvenserte datasett
  • Være i stand til å undersøke og forutsi strukturen i eukaryote-gener
  • Være i stand til å undersøke evolusjonære relasjoner mellom gener og genomer fra ulike arter
  • Vite hvordan du henter data fra elektroniske databaser
  • Være i stand til å få tilgang og forstår vitenskapelig litteratur tilknyttet feltet

Generell kompetanse

Studenten skal

  • Forstå og anvende genomikk og bioinformatiske konsepter knyttet til "cutting edge" havbruksforskning
  • Kunne diskutere og presentere vitenskapelige artikler i genomikk og bioinformatikk
  • Har kompetanse til å delta på forskningsprosjekter innen i bioinformatikk og genomikk
Ingen kostnader utover semesteravgift og pensumlitteratur.

Valgemne:

Master biovitenskap

Nordisk master i bærekraftig produksjon og utnyttelse av marine bioressurser

Forelesninger, veiledning og datalab.
Studieprogrammet evalueres årlig av studentene gjennom emneundersøkelser (midtveisevaluering og sluttevaluering). Evalueringene inngår som en del av universitetets kvalitetssikringssystem.

Sammensatt vurdering, karakterregel Bokstavkarakterer

  • Muntlig presentasjon, teller 40/100 av karakteren, karakterregel Bokstavkarakterer .
  • Oppgave - Skriftlig rapport, teller 60/100 av karakteren, karakterregel Bokstavkarakterer .