Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2024/25)
Akvagenomikk og bioinformatikk
BI311F
Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2024/25)

Akvagenomikk og bioinformatikk

BI311F
Emnet tar for seg grunnleggende bioinformatikk, analyse av DNA-sekvenser, sekvenssammenstillinger, BLAST, annotering av genomer, konstruksjon av fylogenetiske trær, synteni-analyse, og storskala genuttrykk-analyse.
Studenten må være kvalifisert for Master i biovitenskap.

Kunnskap og forståelse

Studenten skal

  • Ha en oversikt over de viktigste sidene ved komparativ og funskjonell genomikk
  • Mestre essensielle bioinformatiske konsepter og ha kjennskap til de riktige bioinformatiske verktøy
  • Ha kunnskap om relevante aspekter innen molekylærbiologi og biokjemi
  • Forstå hvordan genomforskning kan brukes til å løse aktuelle problemer innen akvakultur og økologi
  • Kjenne til prinsipper for dataanalyse av storskala funksjonell genomikk data

Ferdigheter

Studenten skal

  • Ha ferdighet innen databehandling og kunne bruke ulike bioinformatiske applikasjoner
  • Vite hvordan man analyserer store DNA-sekvenserte datasett
  • Være i stand til å undersøke og forutsi strukturen i eukaryote-gener
  • Være i stand til å undersøke evolusjonære relasjoner mellom gener og genomer fra ulike arter
  • Vite hvordan du henter data fra elektroniske databaser
  • Være i stand til å få tilgang og forstår vitenskapelig litteratur tilknyttet feltet

Generell kompetanse

Studenten skal

  • Forstå og anvende genomikk og bioinformatiske konsepter knyttet til "cutting edge" havbruksforskning
  • Kunne diskutere og presentere vitenskapelige artikler i genomikk og bioinformatikk
  • Har kompetanse til å delta på forskningsprosjekter innen i bioinformatikk og genomikk
Ingen kostnader utover semesteravgift og pensumlitteratur.

Valgemne:

  • Master biovitenskap
  • Nordisk master i bærekraftig produksjon og utnyttelse av marine bioressurser

Spesialisering:

  • Master i biovitenskap - genomikk
Forelesninger, veiledning og datalab.
Studieprogrammet evalueres årlig av studentene gjennom emneundersøkelser (midtveisevaluering og sluttevaluering). Evalueringene inngår som en del av universitetets kvalitetssikringssystem.

Sammensatt vurdering, karakterregel Bokstavkarakterer

  • Muntlig presentasjon, teller 40/100 av karakteren, karakterregel Bokstavkarakterer .
  • Oppgave - Skriftlig rapport, teller 60/100 av karakteren, karakterregel Bokstavkarakterer .