Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2019/20)
Akvagenomikk og bioinformatikk
BI311F
Gjeldende emnebeskrivelse (sist oppdatert 2019/20)
Akvagenomikk og bioinformatikk
BI311F
Slik søker du opptak som enkeltemnestudent
Søknadsfrist
Emnet tar for seg grunnleggende dataprogrammering, analyse av DNA-sekvenser, sekvenssammenstillinger, annotering av genomer, konstruksjon av fylogenetiske trær, fylogenetisk footprinting, synteni-analyse, storskala ekspresjons- og epigenomisk-analyse, proteomikk og eksperimental genfunksjonsanalyse på genomnivå.
Studenten må være kvalifisert for Master i biovitenskap.
Studenten må være kvalifisert for Master i Marin økologi eller Master i havbruk.
Kunnskap og forståelse
Studenten skal
- Ha en oversikt over de viktigste sidene ved komparativ og funskjonell genomikk
- Mestre essensielle bioinformatiske konsepter og ha kjennskap til de riktige bioinformatiske verktøy
- Ha kunnskap om relevante aspekter innen molekylærbiologi og biokjemi
- Forstå hvordan genomforskning kan brukes til å løse aktuelle problemer innen akvakultur
- Kjenne til prinsipper for dataanalyse av storskala funksjonell genomikk data
Ferdigheter
Studenten skal
- Ha ferdighet innen databehandling og kunne bruke ulike bioinformatiske applikasjoner
- Vite hvordan man analyserer store DNA-sekvenserte datasett
- Være i stand til å undersøke og forutsi strukturen i eukaryote-gener
- Være i stand til å undersøke evolusjonære relasjoner mellom gener og genomer fra ulike arter
- Vite hvordan du henter data fra elektroniske databaser
- Være i stand til å få tilgang og forstår vitenskapelig litteratur tilknyttet feltet
Generell kompetanse
Studenten skal
- Forstå og anvende genomikk og bioinformatiske konsepter knyttet til "cutting edge" havbruksforskning
- Kunne diskutere og presentere vitenskapelige artikler i genomikk og bioinformatikk
- Har kompetanse til å delta på forskningsprosjekter innen i bioinformatikk og genomikk
Ingen kostnader utover semesteravgift og pensumlitteratur.
Valgemne:
Master i havbruk
Master i marin økologi
Master i havbruk
Master i marin økologi
Forelesninger, veiledning og datalab.
Hvert semester foretas minst én muntlig midtevaluering (dialogmøte med referat) og en elektronisk sluttevaluering i henhold til høgskolens kvalitetssikringssystem. Tilbakemeldingene fra disse evalueringene legger grunnlaget for eventuelle endringer.
På bakgrunn av Covid-19 epidemien blir en rekke vurderinger og eksamener ved Nord universitet endret.
Endringer gjøres ih.h.t Midlertidig forskrift om tillegg til forskrift. 310.12019 nr 63 om studier og eksamener ved Nord universitet- Ekstraordinære tiltak som følge av koronaepidemien jmf § 2, Vurderingsformer ledd 1-3
For å imøtekomme dette, gjennomføres muntlig eksamen våren 2020 digitalt for dette emnet.
Evne til å gjøre utregninger, samt kunnskap om moldkylær biologi, biokjemi er en fordel.
Pensumlitteratur
Språk
Engelsk
Studiepoeng
10
Studiested
Bodø
Ansvarlig fakultet
Fakultet for biovitenskap og akvakultur
Emneansvarlig
